Schrodinger Suitesv2018.1破解版 附破解文件

Schrodinger Suites 2018-1是Schrodinger軟件的最新版本，該軟件是一款計算化學軟件，包括分子建模，藥物設計和材料科學等，主要對Maestro圖形界面、FEP +、分子動力學、AutoQSAR、工作流程和流水線進行了更新和升級，比如通過改進的屬性樹來輕松控制項目表中的顯示屬性，可以指定原子標簽的小數精度，可以在界面中指定自定義熱區，能夠將FEP +結果導出到Excel工作簿中以供進一步分析，新的Bioisoster替代節點，改進了Windows上許多面板的響應能力等等，可以大幅度的提高用戶的工作效率。它是藥物發現的完整軟件包，包括：基于受體和配體結構的誘導契合和柔性對接模式；基于受體結構及配體極性的對接模式；基于受體結構及溶液環境性質的對接模式；組合化學庫設計及基于組合庫的對接模式；基于配體結構的藥物設計，藥效團和3D-QSAR；生物分子結構模擬，蛋白、糖、核酸、小肽等；基于靶點的藥物設計；ADME性質預測。小編給大家帶來了Schrodinger Suites 2018.1破解版，數據包內附帶破解文件，可以完美激活、注冊授權軟件，解鎖軟件中被限制的很多功能，用戶就可以免費、無功能限制使用了。另外，本文提供圖文結合的詳細軟件破解教程，可供大家參考借鑒，大家可以參照具體步驟進行軟件安裝破解操作，希望對大家有幫助，小編親測可用，歡迎有需求的用戶前來免費下載使用。

破解教程

1、下載并解壓Schrodinger Suites 2018-1破解版安裝包壓縮包，解壓密碼為0daydown，然后雙擊運行“setup.exe”程序進行軟件安裝。

2、進入安裝向導界面，根據安裝提示進行安裝，直到軟件安裝完成。

3、軟件安裝完成，點擊“ok”退出安裝程序。

4、在桌面或者開始菜單找到軟件并選中Schrodinger Suites，點擊鼠標右鍵，選擇“打開文件位置”進入軟件安裝路徑，將patcher文件夾內的patcher.exe這個破解文件復制到軟件安裝路徑下。

5、在軟件安裝路徑下雙擊運行此破解文件，彈出界面，點擊patch即可激活破解軟件。

6、然后點擊開始菜單，Schrodinger 2018-1軟件中的模塊軟件都可以免費使用了。

7、打開幾個試下，均可以正常使用。

功能特色

一、Maestro圖形界面
1、通過改進的屬性樹，輕松控制項目表中的顯示屬性
2、在收藏夾工具欄中編輯標題
3、交互調整環形構造
4、查找核心Maestro功能，例如作為任務工具中的Surface和Hydrogen Bond面板 
5、支持Mac觸控板手勢，包括縮放和Z軸旋轉 
6、可選擇禁用預測高亮顯示
7、控制超出選定范圍的網格范圍計算PB靜電表面的原子數
8、可選擇指定原子標簽的小數精度 - 包括幾個新學院教程
二、FEP +
1、可選擇指定界面中的自定義熱區域。單獨控制受體和配體原子?？焖俨榭达@示溶劑和復雜腿部的熱原子
2、檢查共價結合蛋白質 
3、配體系統的邊緣分析
4、報告配體健康評估中與水分子的空間沖突
5、將FEP +結果輸出到Excel用于進一步分析的工作簿
6、將FEP +結果導入LiveDesign 
7、添加到文檔中的新學院教程
三、分子動力學
改進的膜松弛協議
四、AutoQSAR
輕松構建和應用深度學習模式使用我們的基于TensorFlow的DeepChem集成。適用于對大型數據集進行建模，可處理數十萬種化合物
五、工作流和流水線
1、Schrodinger Suites包括最新版本的KNIME（v3.5)
2、New Bioisoster更換節點
3、Maestro中KNIME工作流程支持的新快速表單節點
4、抗體構建的新工作流程示例和序列轉換器
5、改進了Windows上許多面板的響應速度
6、提高了2D渲染器的速度

模塊簡介

Glide：精確的配體和受體的對接（docking）工具。Glide提供SP（標準精度）和XP（額外精度）兩種方式為藥物發現提供了速度和精度，在SP（標準精度）高精度的對接幾十萬個配體基礎上， XP（額外精度）模式可以對SP的對接結果做進一步檢驗，以減少假陽性。GlideScore充分考慮親脂性，氫鍵，金屬配位體的貢獻，也考慮不合適的鍵的旋轉和原子的空間排斥，可以有效的減少假陽性和提高富集率。另外含有的SP-QPLD和XP-QPLD打分可以考慮配體在受體內的極性取向。Glide 和Prime模塊聯用可以實現Induced Fit功能。
Maestro：是Schr?dinger軟件的統一界面，超強的圖像顯示功能使研究人員能清楚的觀察最復雜的研究體系。
Prime: 精確的蛋白結構預測軟件包。Prime可以模建出高精度的受體模型，保證藥物研發后期的成功。Prime可精確模建Loop區。包含同源模建和threading兩種方法。
Liaison：精確的配體-受體結合能計算程序，Liaison預測結合能在~1 kcal/mol的實驗值，可以應用到配體自由度比較大的情況。
SiteMap: 精確的蛋白活性位點認證工具。 包含兩部分功能：活性位點定位；分析活性位點的化學特征。
CombiGlide：設計針對一個靶標或者一類靶標的富集組合庫，并利用靶標結構基于組合庫虛擬篩選程序。通過特定的設定過濾化合物，例如ADME預測。并可實現De novo design。
Epik：快速和精確的預測pKa。Epik能夠得到pKa值和3D結構文件，包括多種互變異構體和在特殊條件下可能存在的離子狀態，在水和DSMO的溶液中，也能精確的計算出pKa值?？梢杂行岣吆Y選的準確性。
MacroModel: 基于力場模建的黃金標準?？商幚眢w系包括有機化合物、糖、核酸、小肽、蛋白等。在研究蛋白-配體的復合物，允許活性位點充分的柔性，而其他的地方剛性。
Qsite：高性能的QM/MM計算程序。Qsite將量子力學計算應用到蛋白的活性位點的活性中心，對于剩余的蛋白體系應用分子動力學，是先導優化的強有力的工具?？蓱迷谏婕暗诫娮愚D移的酶的催化反應及蛋白活性中心含金屬的體系。
Phase: 最精確的藥效團模建的完整工具包。Phase可以基于配體設置排斥球，假設某些區域被蛋白質所占據，這樣就把空間形狀不符合的配體篩掉?？梢愿鶕潴w-受體復合物結構中配體的晶體結構生成藥效團搜索數據庫。具有強大的數據管理功能，Phase允許用戶生成和存儲多構象的數據庫，以便在工作中隨時用來篩選。包含的ConfGen技術對配體分子進行考察，包括鍵的旋轉，和計算各個構象的能量，以保留合理的構象。
Strike: 做統計模型和QSAR的工具。 Strike是做結構-活性關系模型的工具, Strike能使用這個模型快速的預測化合物活性或者預測大的虛擬庫的像藥性。
QikProp：快速精確的ADME的預測工具。由耶魯大學的Bill Jorgensen教授實驗室設計?？梢詫φ麄€分子的3D結構預測，預測性質包括：辛醇/水和水/氣體的log Ps, log S, log BB；整個CNS活性；Caco-2和MDCK細胞滲透性；血清白蛋白結合活性log Khsa；HERG 的K離子通道阻斷性log IC50。
LigPrep：精確的2D到3D結構的轉換的工具。有效精確的2D到3D的轉換是成功藥物設計的第一步，LigPrep可從單一結構產生的化學和結構上的多樣構象。 LigPrep可以為Glide，Qikprop，和Phase產生輸入文件。為了符合模擬程序的需要, LigPrep提供的特殊設定可優化輸出結構。
PrimeX：蛋白質X-ray晶體結構精修。包括正確放置配體，Loop區構建以及模擬退火功能。
Jaguar: 快速的第一原理電子結構計算軟件包, 可以將量子化學的精確性引入生命科學研究。

解決方案

（一）高通量虛擬篩選：薛定諤軟件的虛擬篩選功能在35個CPU的集群上每天可以篩選150萬個化合物。提供一站式的設置界面，用戶可以定義特定的性質，以便過濾掉不滿足性質的化合物；所需模塊：Glide, LigPrep, QikProp, Epik, Sitemap, Liaision；
（二）精確對接：針對虛擬篩選后的富集化合物庫或者用戶自己特定的化合物庫，利用薛定諤軟件提供的精確對接模式可以考慮以下兩種真實環境，得到的精確度結果可以和實驗的結果相匹配：
（1）配體小分子對蛋白活性位點結構的誘導(Induced Fit)；所需模塊：Glide, Prime, Liaison, Sitemap, Epik, MacroModel, LigPrep, QikProp；
（2）蛋白分子誘導配體分子電荷的極化(QPLD)，所需模塊：Glide, Liaison, Sitemap, Epik, MacroModel, Qsite, Ligprep, Jaguar, QikProp；
（三）藥效團和3D-QSAR：薛定諤提供的藥效團和3D-QSAR的解決方案，在沒有受體信
息的情況下，科研人員可以用活性配體的信息進行新藥設計；所需模塊：Phase, Confgen, Ligprep, MacroModel, Strike；
（四）全新藥物設計（de novo design）：薛定諤軟件提供的me-too和me-better藥物設計解決方案，允許用戶替換已知化合物的側鏈或者母核；所需模塊：CombiGlide, Glide, Ligprep, Qikprop；
（五）酶催化，金屬酶研究（QM/MM方法）：薛定諤軟件提供的QM/MM方法可以考慮蛋白活性位點的化學反應。所需模塊：Qsite, Jaguar；
（六）生物分子結構模擬：可以精確模建蛋白、核酸、多糖結構；所需模塊Prime, MacroModel；
（七）ADME性質預測：應用于藥理方面的研究；所需模塊：QikProp；
（八）化學信息學：薛定諤軟件的化學信息學解決方法提供以下專業算法：二元指紋向量聚類分析；相似性分析；層次聚類方法；化學過濾方法；多樣性分析；sphere exclusion diversity;字結構搜索；獨特的SMILES產生法；多元線性回歸；偏最小二乘回歸；主成份分析；主成份回歸分析；神經網絡算法；樸素貝葉斯分析算法；自組織特征映射法；所需模塊：Canvas；