ImageJ是一款基于java的圖像分析軟件。該軟件可以進行顯示、編輯、分析、處理、保存和打印8位、16位和32位圖像。具體可應用于細胞計數masson染色，茜素紅染色，鼠腦切片的梗塞區域面積的計算，血管分析，三維及多維圖像的分析及其可視化等形態學分析。目前支持的圖像格式包括TIFF，GIF，JPEG，BMP，DICOM，FITS和RAW等多種圖像格式。并且軟件不受操作系統的限制，官方發布了windows，linux以及mac不同操作系統的版本，小編帶來的是Windows版本，需要的朋友可來本站下載。
軟件特色
1、支持多平臺：軟件是用Java編寫的，它允許它在32位和64位模式下在Linux，Mac OS X和Windows上運行。
2、開源：
軟件及其 Java源代碼 在公有領域免費提供 。不需要許可證
3、用戶社區：
軟件擁有一個龐大且知識淵博的全球用戶社區。超過1700位用戶和開發人員訂閱了郵件列表。
4、宏：
使用宏自動化任務并創建自定義工具 。使用命令記錄器生成宏代碼， 并使用 宏調試器進行調試。 ImageJ網站上提供了300多個宏 。
5、插件：
通過使用軟件內置的
文本編輯器和Java編譯器開發插件來擴展ImageJ。有超過500個插件可用。
6、工具包：
使用軟件作為圖像處理工具包（類庫）來開發 applet，servlet或應用程序。
7、速度：
軟件是世界上最快的純Java圖像處理程序。它可以在0.1秒（*）中過濾2048x2048圖像。這是每秒4000萬像素！
8、數據類型：
8位灰度或索引顏色，16位無符號整數，32位浮點和RGB顏色。
9、文件格式：
將所有支持的數據類型打開并保存為TIFF（未壓縮）或原始數據。打開并保存GIF，JPEG，BMP，PNG，PGM，FITS和ASCII。打開DICOM。使用URL打開TIFF，GIF，JPEG，DICOM和原始數據。使用插件打開并保存許多其他格式 。
10、圖像顯示：
提供了縮放工具（1:32到32：1）和滾動圖像。所有分析和處理功能均可以任何放大系數工作。
11、選擇：
創建矩形，橢圓形或不規則區域選擇。創建線和點選擇。編輯選擇并使用魔杖工具自動創建它們。繪制，填充，清除，過濾或測量選擇。保存選擇并將其轉移到其他圖像。
12、圖像增強：
支持8位灰度和RGB彩色圖像的平滑，銳化，邊緣檢測，中值濾波和閾值處理。交互調整8、16和32位圖像的亮度和對比度。
13、幾何操作：
裁剪，縮放，調整大小并旋轉。垂直或水平翻轉。
14、分析：
測量面積，平均值，標準偏差，最小和最大選擇或整個圖像。測量長度和角度。使用真實世界的測量單位，如毫米。使用密度標準校準。生成直方圖和輪廓圖。
15、編輯：
剪切，復制或粘貼圖像或選擇。使用AND，OR，XOR或“Blend”模式進行粘貼。向圖像添加文本，箭頭，矩形，橢圓或多邊形。
16、顏色處理：
將32位彩色圖像分割成RGB或HSV組件。將8位組件合并成彩色圖像。將RGB圖像轉換為8位索引顏色。將偽調色板應用于灰度圖像。
17、棧：
在單個窗口中顯示相關圖像的“堆疊”。使用單個命令處理整個堆棧。打開圖像文件夾作為堆棧。將堆棧保存為多圖像TIFF文件。
更新日志
imagej 1.51更新：
1、在ROI管理器中添加超級投資回報率時，如果顯示模式為“復合”，則通道位置設置為0（在所有通道中顯示）。
2、添加了setOption（“ConvertToMicrons”，boolean）宏函數。設置此選項時，如果像素寬度小于0.0001厘米，TIFF圖像中的單位將轉換為微米。
3、修復了一個錯誤，導致使用“＆”符號傳遞變量的宏失敗，如果他們使用 Process> Math> Macro命令來處理堆棧。
4、修正了1.51o的回歸，有時在打開或處理圖像時有時會導致軟件凍結在Windows上。
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