Arlequin3.5是一款專業(yè)的人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析軟件，它的主要目的是為群體遺傳學(xué)的普通用戶提供相當(dāng)多的基本方法和統(tǒng)計檢驗，以便提取有關(guān)人口樣本集合的遺傳和人口統(tǒng)計特征的信息，從而在允許用戶快速選擇他們想要對其數(shù)據(jù)執(zhí)行的不同分析。你可以通過軟件對統(tǒng)計數(shù)據(jù)中信息的挖掘，可進(jìn)行AMOVA計算、中性檢驗、錯配分布等。本軟件主要為從事醫(yī)學(xué)、生物學(xué)研究的用戶設(shè)計，可以從遺傳學(xué)和人口統(tǒng)計學(xué)數(shù)據(jù)中挖掘信息，例如：大量的分子序列數(shù)據(jù)和傳統(tǒng)的等基因頻率，并提供了很多的方法和統(tǒng)計學(xué)檢驗，能夠滿足用戶多種遺傳學(xué)分析方便的需求！集成了單倍型頻率估計、Tajima中性檢驗、Fu中性檢驗以及遺傳距離的估計等功能，這樣就能夠準(zhǔn)確有效的對人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘。
小編給大家?guī)砹?strong>Arlequin3.5軟件綠色版下載，免安裝軟件，面向所有用戶完全免費(fèi)開放，下載即可打開使用，除去了繁瑣的安裝操作步驟，給用戶在使用軟件上提供便利，節(jié)省大量時間。軟件更重要的是便于攜帶，可以放在U盤或者其他設(shè)備上使用，體積小巧，占用內(nèi)存空間小，運(yùn)行速度快，不卡頓不拖慢程序，給你帶來一個優(yōu)質(zhì)良好的使用體驗，保持系統(tǒng)運(yùn)行穩(wěn)定，需要的用戶歡迎前來下載使用。
功能特色
1、Molecular diversity(分子多態(tài)性)
2、Mismatch distribution(錯配分布)
3、Haplotype frequency estimation(單倍型頻率估計)
4、Linkage disequilibrium(連鎖不平衡：檢測不同位點上等位基因的非隨機(jī)關(guān)聯(lián))
5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈溫—伯格平衡)
6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性檢驗)
7、Fu`s neutrality test(Fu中性檢驗)
8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性檢驗)
以上三個中性檢驗都是基于無限位點模型，適用于DNA sequence 和 RFLP單倍型。
9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合檢驗，檢測人群的均一性或同質(zhì)性和中性選擇等)
10、Minimu Spanning Network(MSN，最小擴(kuò)張樹或稱之為最小支撐樹,，基于分子差異)
11、AMOVA 分子差異度分析，用以評測人群的遺傳結(jié)構(gòu)
12、Pairwise genetic distances (遺傳距離的估計)
13、Exact test of population differentiation (檢測隨機(jī)交配群體單倍型的非隨機(jī)分布)
14、Assignment test of genotype (通過估計等位基因頻率將單個基因型分配到特定的人群中)
更新日志
Arlequin v3.5.2.2更新：
1、新功能：
直接從DNA序列數(shù)據(jù)計算位點頻譜，但僅基于次要等位基因頻譜的SFS計算?
2、錯誤更正：
無法打開批處理（.arb）文件
當(dāng)（假設(shè)祖先等位基因0）在一個站點不存在時，SFS計算不良
由arlequin和fastsimcoal2生產(chǎn)的不同SFS（主要用于基于MAF的SFS）
如果文件名超過255個字符，則會出錯
在arlequin日志文件中沒有提到SFS計算
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