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Arlequin3.5軟件綠色版v3.5.2.2

大?。?4.79MB語言:英文類別:健康醫藥

類型:國外軟件授權:免費軟件時間:2019/6/24

官網:

環境:Windows7,WinVista,WinXP

安全檢測:無插件360通過騰訊通過金山通過瑞星通過

本地下載

Arlequin3.5是一款專業的人類遺傳學數據分析軟件,它的主要目的是為群體遺傳學的普通用戶提供相當多的基本方法和統計檢驗,以便提取有關人口樣本集合的遺傳和人口統計特征的信息,從而在允許用戶快速選擇他們想要對其數據執行的不同分析。你可以通過軟件對統計數據中信息的挖掘,可進行AMOVA計算、中性檢驗、錯配分布等。本軟件主要為從事醫學、生物學研究的用戶設計,可以從遺傳學和人口統計學數據中挖掘信息,例如:大量的分子序列數據和傳統的等基因頻率,并提供了很多的方法和統計學檢驗,能夠滿足用戶多種遺傳學分析方便的需求!集成了單倍型頻率估計、Tajima中性檢驗、Fu中性檢驗以及遺傳距離的估計等功能,這樣就能夠準確有效的對人類遺傳學數據進行挖掘。
小編給大家帶來了Arlequin3.5軟件綠色版下載,免安裝軟件,面向所有用戶完全免費開放,下載即可打開使用,除去了繁瑣的安裝操作步驟,給用戶在使用軟件上提供便利,節省大量時間。軟件更重要的是便于攜帶,可以放在U盤或者其他設備上使用,體積小巧,占用內存空間小,運行速度快,不卡頓不拖慢程序,給你帶來一個優質良好的使用體驗,保持系統運行穩定,需要的用戶歡迎前來下載使用。
Arlequin3.5軟件綠色版

功能特色

1、Molecular diversity(分子多態性)
2、Mismatch distribution(錯配分布)
3、Haplotype frequency estimation(單倍型頻率估計)
4、Linkage disequilibrium(連鎖不平衡:檢測不同位點上等位基因的非隨機關聯)
5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈溫—伯格平衡)
6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性檢驗)
7、Fu`s neutrality test(Fu中性檢驗)
8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性檢驗)
以上三個中性檢驗都是基于無限位點模型,適用于DNA sequence 和 RFLP單倍型。
9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合檢驗,檢測人群的均一性或同質性和中性選擇等)
10、Minimu Spanning Network(MSN,最小擴張樹或稱之為最小支撐樹,,基于分子差異)
11、AMOVA 分子差異度分析,用以評測人群的遺傳結構
12、Pairwise genetic distances (遺傳距離的估計)
13、Exact test of population differentiation (檢測隨機交配群體單倍型的非隨機分布)
14、Assignment test of genotype (通過估計等位基因頻率將單個基因型分配到特定的人群中)

更新日志

Arlequin v3.5.2.2更新:
1、新功能:
直接從DNA序列數據計算位點頻譜,但僅基于次要等位基因頻譜的SFS計算?
2、錯誤更正:
無法打開批處理(.arb)文件
當(假設祖先等位基因0)在一個站點不存在時,SFS計算不良
由arlequin和fastsimcoal2生產的不同SFS(主要用于基于MAF的SFS)
如果文件名超過255個字符,則會出錯
在arlequin日志文件中沒有提到SFS計算
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